科学技术研究院

面向总装备部、各军兵种、国防科工委、军工各集团及研究院所、军工企业，国家自然科学基金委、教育部及学术交流、国际合作。

装备科研部：
总装备部所有计划项目、总参谋部及各军兵种计划项目及其横向协作项目

军工基础与协作部：
国防基础科研计划项目、各军工集团横向协作项目、国防科技各层次实验室、应用研究中心、研保与技术改造投资项目等。

基础研究部：
国家自然科学基金、省市各类基金、国家各类科技人才基金项目，国际科技合作与学术交流，理科、文科建设。

工业技术研究院

面向科技部、教育部、发改委等中央各部委及中央企业，地方政府（各省、市）和各类企业民品科研及国家级基地建设与管理。

民品科研部：
面向科技部、教育部、发改委、信息产业部、交通部等国家各部委及中央企业的纵向民品科研。

科技开发部
面向地方政府（各省、市）和各类企业，涉及科技项目、联合机构、参展活动；成果孵化、技术转移，按企业化运作的科研项目管理。

平台与基地建设部：
依托学校建设的国家级、省部级重点实验室、工程实验室及工程中心，校级科研机构以及与校外单位的联合机构的立项、建设、评估、审批和管理。

基础与交叉科学研究院

直属单位的综合管理，包括理学研究中心、微纳米技术研究中心、高超声速技术中心等基础、新兴和交叉科学研究的孵化 与培育，人力资源管理与研究生管理、研究生培养，科学园物业管理。

科研生产管理中心

科研项目的公共管理，包括科学与工业技术研究院办公室职能、重大标志性项目、批产等效益化项目的管理等，下设综合 办公室和三个专项办公室：项目管理办公室、成果与知识产权管理办公室、质量 与认证中心。